Perbedaan Kunci – Gel Elektroforesis vs Halaman SDS
Elektroforesis gel adalah teknik yang memisahkan makromolekul dalam medan listrik. Ini adalah metode umum dalam biologi molekuler untuk memisahkan DNA, RNA dan protein dari campuran sesuai dengan ukuran molekulnya. SDS Page adalah jenis elektroforesis gel yang digunakan untuk memisahkan protein dari campuran protein berdasarkan ukurannya. Elektroforesis gel adalah istilah yang digunakan untuk merujuk pada teknik normal yang diterapkan untuk pemisahan DNA, RNA , dan protein sedangkan SDS Page adalah salah satu jenis elektroforesis gel. Ini adalah perbedaan utama antara elektroforesis gel dan Halaman SDS.
ISI
1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu Elektroforesis Gel?
3. Apa itu Halaman SDS
4. Perbandingan Berdampingan – Elektroforesis Gel vs Halaman SDS
5. Ringkasan
Apa itu Elektroforesis Gel?
Elektroforesis gel adalah teknik umum yang digunakan di laboratorium untuk memisahkan molekul bermuatan seperti DNA, RNA, protein, dll. dari campurannya. Gel digunakan dalam elektroforesis gel. Ini bertindak sebagai saringan molekuler. Ada dua jenis gel yang digunakan dalam elektroforesis gel yaitu agarosa dan poliakrilamida . Pemilihan gel dan preparasi gel merupakan faktor penting yang harus dipertimbangkan dalam elektroforesis gel karena ukuran pori gel harus dimanipulasi secara hati-hati untuk pemisahan molekul yang baik melalui elektroforesis gel. Elektroforesis gel memiliki medan listrik yang terhubung ke dua ujung gel. Salah satu ujung gel menunjukkan muatan positif sedangkan ujung lainnya bermuatan negatif.
DNA dan RNA adalah molekul bermuatan negatif. Begitu mereka dimasukkan ke dalam gel dari ujung negatif gel dan diterapkan ke medan listrik, mereka bermigrasi melalui pori-pori gel menuju ujung gel yang bermuatan positif. Kecepatan migrasi tergantung pada muatan dan ukuran molekul. Molekul yang lebih kecil dengan mudah bermigrasi melalui pori-pori gel daripada molekul yang lebih besar. Oleh karena itu, molekul yang lebih kecil menempuh jarak yang jauh melalui gel dan molekul yang lebih besar menempuh jarak yang pendek. Untuk mengamati perjalanan molekul pada gel, digunakan jenis pewarna khusus. Medan listrik diterapkan untuk jangka waktu tertentu dan berhenti untuk mencegah hilangnya molekul dan untuk menjaga molekul pada posisi perjalanan mereka. Pita yang berbeda dapat diamati dalam gel. Pita ini mewakili molekul dengan ukuran berbeda. Oleh karena itu, elektroforesis gel berguna untuk membedakan molekul menurut ukurannya.
Elektroforesis gel dimasukkan ke dalam berbagai teknik sebagai teknik persiapan dalam biologi molekuler seperti PCR , RFLP , kloning , sekuensing DNA , blotting selatan , pemetaan genom, dll.
Gambar 01: Elektroforesis gel agarosa
Apa itu Halaman SDS?
Sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis (SDS Page) adalah jenis elektroforesis gel yang digunakan untuk memisahkan protein. Ketika elektroforesis gel digunakan untuk memisahkan protein, diperlukan perlakuan khusus karena protein tidak bermuatan negatif seperti DNA dan RNA dan tidak bermigrasi ke ujung positif atau ujung negatif. Oleh karena itu, protein didenaturasi dan dilapisi dengan muatan negatif sebelum elektroforesis gel. Itu dilakukan dengan menggunakan deterjen yang disebut sodium dodecyl sulfate (SDS). Elektroforesis gel yang menggunakan SDS dan gel poliakrilamida untuk media pendukungnya dikenal sebagai SDS Page. Teknik ini umumnya digunakan dalam biokimia, genetika, forensik dan biologi molekuler.
Selama Halaman SDS, protein dicampur dengan SDS. SDS membuka protein menjadi bentuk linier dan melapisinya dengan muatan negatif yang sebanding dengan massa molekulnya. Karena muatan negatif, molekul protein bermigrasi ke arah ujung muatan positif gel dan terpisah menurut massa molekulnya. Di SDS Page, poliakrilamida digunakan sebagai pendukung padat untuk gel. Pemisahan sebenarnya dari protein terutama tergantung pada sifat gel. Oleh karena itu, preparasi gel poliakrilamida harus dilakukan dengan hati-hati dan konsentrasi poliakrilamida yang benar harus digunakan. Gel poliakrilamida menunjukkan resolusi tinggi dibandingkan gel agarosa. Oleh karena itu, SDS Page dianggap sebagai teknik resolusi tinggi untuk pemisahan protein.
SDS Page adalah jenis elektroforesis gel denaturasi. Ini memiliki keterbatasan utama dalam analisis protein. Karena SDS mendenaturasi protein sebelum pemisahan, SDS tidak memungkinkan deteksi aktivitas enzimatik, interaksi pengikatan protein, kofaktor protein, dll.
Gambar 02: Halaman SDS
Apa perbedaan antara Elektroforesis Gel dan Halaman SDS?
Gel Elektroforesis vs Halaman SDS | |
| Elektroforesis gel adalah metode yang dilakukan untuk memisahkan makromolekul menggunakan medan listrik. | SDS Page adalah teknik elektroforesis gel resolusi tinggi yang digunakan untuk memisahkan protein berdasarkan massanya. |
| lari gel | |
| Itu dapat dilakukan secara horizontal atau vertikal. | Halaman SDS selalu berjalan secara vertikal. |
| Dasar untuk Pemisahan | |
| Pemisahan terjadi menurut muatan dan ukurannya. | Pemisahan protein terjadi menurut massa dan muatannya. |
| Resolusi | |
| Elektroforesis gel agarosa memiliki resolusi rendah dan elektroforesis gel poliakrilamida memiliki resolusi yang lebih tinggi | SDS Page memiliki resolusi yang lebih baik. |
| Denaturasi | |
| Elektroforesis gel mencakup teknik denaturasi dan non denaturasi. | SDS Page mendenaturasi protein sebelum pemisahan. |
Ringkasan – Gel Elektroforesis vs Halaman SDS
Elektroforesis gel adalah teknik umum yang digunakan untuk pemisahan dan analisis DNA, RNA, dan protein berdasarkan ukuran dan muatannya. Ada dua jenis utama elektroforesis gel yaitu elektroforesis gel agarosa dan elektroforesis gel poliakrilamida. Gel agarosa digunakan terutama untuk pemisahan asam nukleat; ketika resolusi yang lebih tinggi diperlukan, gel poliakrilamida digunakan. SDS Page adalah jenis elektroforesis gel yang biasa digunakan untuk memisahkan campuran kompleks protein. Ini dianggap sebagai teknik pemisahan protein resolusi tinggi. Inilah perbedaan antara elektroforesis gel dan Halaman SDS.
Referensi:
1. Nowakowski, Andrew B., William J. Wobig, dan David H. Petering. “Native SDS-PAGE: Pemisahan Elektroforesis Resolusi Tinggi dari Protein Dengan Retensi Sifat Asli Termasuk Ion Logam Terikat. www.ncbi.nlm.nih.gov. Np, Mei 2014. Web. 7 April 2017
2. Stellwagen, Nancy C. "Elektroforesis DNA dalam gel agarosa, gel poliakrilamida dan dalam larutan bebas." Elektroforesis. Perpustakaan Kedokteran Nasional AS, Juni 2009. Web. 07 April 2017
Gambar Courtesy:
1. "Gelelektroforeseapparatur" (CC BY-SA 3.0) melalui Commons Wikimedia
2. "Elektroforesis gel Agarosa DNA" Oleh Sekolah Sumber Daya Alam dari Ann Arbor - lab DNA (CC BY 2. 0) melalui Commons Wikimedia
